После основания города Никополь в Эпире, Керкира теряет некоторые политические и экономические позиции и отходит на второй план.
Когда норманнское королевство на Сицилии и итальянский флот укрепились, они стали подыскивать земли для захвата. Остров Керкира (Корфу) снова стал очень привлекательным для завоевателей.
В 1081—1085 годах остров Корфу находился под влиянием Роберта Гвискара, в 1147—1154 годах — Рожера II Сицилийского. Когда крестоносцы разгромили Византию, в 1197-1207 годах Корфу захватили генуэзские корсары, которых после вытеснили венецианцы.
В период с 1214 по 1259 Корфу принадлежал греческому Эпирскому деспоту, а с 1267 года - Неаполитанскому королевству.
На Корфу постоянно нападали захватчики и в 1386 году остров попросил защиты у Венецианской республики. А в 1401 Вецеция объявила о формальной независимости Керкиры (Корфу).